Un jour, pendant qu'un groupe de plongeurs exploraient les fonds marins, ils aperçurent une lumière au fond de l'océan. Peu après avoir continué vers elle, ils se retrouvèrent emportés soudainement par un violent courant qui les attirait au coeur d'une bulle gigantesque qui se trouvait au bout. À leur réveil, ils se rendirent compte qu'ils se trouvaient dans une région protégée par un dôme portant jusqu'à l'horizon et où cohabitaient de nombreux pokémon.
Votre rôle est de découvrir comment regagner votre monde en parcourant les villes et raconter aux gens ce que vous avez découvert pour qu'ils puissent investir les lieux et la faire profiter aux autres.
Au nombre de trois, vous êtes en plein coeur de la région. Par où allez-vous commencer ? Vous avez heureusement pensé à prendre vos compagnons avec vous mais vous devrez chercher le moyen de revenir dans votre monde sinon vous resterez bloqué pour toujours...